微观重建与智能分析团队主要研究如何从微观尺度解析大脑网络结构和启发类脑计算智能。

微观重建与智能分析团队创建于2015年8月，在国内率先开展微观尺度脑连接图谱技术体系的研发，包括大体积生物样品制备、高通量电镜三维成像、多模态神经三维重构和跨尺度神经网络建模等共性关键技术。2020年建设了国际一流水平的微观尺度脑连接图谱技术平台（Center for Microscale Connectomics），具备开展大规模微观脑连接组图谱工程的全链条技术能力，同步应用推广到生物医学病理、类神经仿生模型、AI for Science等领域，与国内多个领域的顶尖水平课题组开展深入合作研究。

微观重建与智能分析团队现有科学研究和工程技术人员30余名（正高3名副高7名），博士研究生10余名，大型仪器设备30余台套，实验环境超过1000平米。承担多项国家科技重大专项、中科院先导专项和北京市科技专项等重大项目。发表学术论文100余篇，包括TPAMI/ESWA/TNNLS、IJCAI/CVPR/MICCAI、Science/Nature Commun./Cell Reports/Plant Cell/BMC Biology等，授权国家发明专利30余项。